白颊猕猴：国家二级保护动物，属林芝特有，是2015年科研人员在墨脱发现的灵长类新物种。国家林草局最新公布的《中国国家重点保护野生动物名录》首次将其列入国家二级重点保护野生动物。

　　戴帽叶猴：国家一级保护动物，主要分布在墨脱县，是西藏第二次陆生野生动物资源调查时在林芝发现的野生动物新分布记录。

　　云豹：国家一级保护动物，是猫科云豹属野生动物，因皮毛上像云朵一样的花纹而得名。主要分布在热带、亚热带常绿林区，非常善于攀爬，是树栖性很强的兽类。

　　金猫：国家一级保护动物，是一种中型的林栖猫科动物，毛色随区域环境的变化较大，根据其斑纹特征可分为红棕色型、灰色型、麻褐色型、花斑型和黑色型五大类，林芝市察隅县、墨脱县均有分布。

　　豺：国家一级保护动物，又叫“豺狗”“红狼”，体形小于狼，吻较狼短而头较宽，耳短而圆，四肢较短，尾巴尖黑色。豺既能抗寒，也能耐热，属群居性，集体猎食，在林芝市分布于墨脱等地。

　　喜马拉雅鬣羚 ：国家一级保护动物，是我国分布的四种鬣羚之一，被称为“四不像”。常活动于亚热带山地及暖温带地区的森林中，单独或成小群生活，可以灵活地在陡峭的山岩上攀爬，林芝市主要分布在墨脱等地。

　　贡山羚牛：国家一级保护动物，隶属偶蹄目牛科，雌雄均拥有一对由上又后转向外的角，所以又被称作扭角羚。体型壮硕，喜欢群居，常活动于海拔1200米至4500米之间，随季节变化而垂直迁移，林芝市察隅、墨脱等地有分布。

　　马麝：国家一级保护动物，又称为“黄獐子”，雄性有月牙状上犬齿，雌雄均不长角。栖息地海拔3000米至5200米，活动于林线上缘的高山杜鹃丛和长有高山柳、金露梅等的灌丛中，常单独活动，林芝市大部分地区都有分布。

　　黄喉貂：国家二级保护动物，因前胸部有明显的黄橙色喉斑而得名，以肉食为主，性情凶狠，单独或数只集群猎捕中小型偶蹄类，常活动于常绿阔叶林和针阔叶混交林区，林芝市大部分地区都有分布。

　　黑鹇：国家二级保护动物，又名“黑鸡”，中型鸟类，雄鸟头顶有黑色羽冠，脸部裸皮呈红色。多栖息于海拔2100米至3500米的阔叶林及灌丛中，集群活动，林芝市墨脱、察隅、波密等地都有分布。