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中国发布荷斯坦牛中高密度基因组选择育种芯片

发布时间:2023-09-20 16:55:00来源: 人民网-湖南频道

  人民网长沙9月15日电 一张全基因组育种芯片上均匀分布超12万个基因位点,平均检出率达99.5%,重复样品检测平均一致性达99.4%,盲样检测性能良好,达到国际先进水平……近日,中国荷斯坦牛中高密度基因组选择育种芯片发布,标志着我国荷斯坦牛中高密度育种芯片自主设计开发取得重要突破。

  据悉,荷斯坦牛是当前世界奶牛的主要品种,作为单胎大型动物,选择出优秀种公牛是奶牛育种的核心工作。目前,国际上已进入奶牛基因组选择育种时代,使用中高密度育种芯片,能使种公牛培育周期由约6年缩短至约2年,育种效率显著提升。

  “十四五”国家重点研发计划项目首席科学家、中国农业大学教授孙东晓就表示,我国近年来加速构建和优化奶牛基因组选择育种技术平台,但过去完全依赖国外育种芯片,国内种牛检测样品需要送到国外实验室检测,存在技术“卡点”及生物信息安全风险。

  在奶牛基因组选择育种时代,高通量SNP检测技术平台堪称育种“芯片”,为实现我国国产奶牛育种芯片零的突破,2020年8月,首农食品集团北京奶牛中心、中国农业大学、华智生物技术有限公司启动奶牛育种芯片自主设计开发联合攻关。

  奶牛育种芯片自主开发经历了一系列科学、严谨的设计、验证和反复论证,攻关团队基于中国荷斯坦牛群体挖掘验证了一大批效应显著的基因突变位点,最终自主设计了涵盖超12万个位点(即126K)的育种芯片,该款芯片不仅兼容现有参考群和多款商业化芯片位点信息,还提高了芯片数据填充准确性及奶牛基因组遗传评估准确性。

  奶牛126K液相基因组育种芯片通过了专家论证,专家组认为芯片设计科学合理,经过检测验证、盲样复检、多平台对比、填充效果验证等多轮测试,验证程序完善。参照国际同类产品标准,达到产业化推广应用水平,可用于荷斯坦牛基因组选择参考群体的构建及种牛评价。

  “这是我国荷斯坦牛育种领域首款中高密度育种芯片,对提升我国种公牛自主培育能力和水平,进一步完善奶牛种质自主评价体系具有重要意义。”中国奶业协会副秘书长陈绍祜说。

  中国奶业协会育种专业委员会主任麻柱说,奶牛育种自主创新联盟将率先用上这款芯片,助力保障我国奶牛自主选育体系稳定运行,维护生物信息安全,并将进一步提升我国奶牛自主选育能力,助力奶牛种业振兴。(林洛頫、龙宇)

(责编:李文治)

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